Białostocki wariant korytarza W wariancie białostockim międzynarodowa droga ekspresowa Via Baltica ma przeciąć nie tylko unikalną dolinę Biebrzy, ale także cenną przyrodniczo dolinę Narwi oraz Puszczę Augustowską i Knyszyńską. Są to cztery ostoje ptaków o znaczeniu międzynarodowym, w większości chronione prawem polskim, które mają być włączone do europejskiej sieci obszarów chronionych Natura 2000. Straty środowiskowe, jakie spowoduje inwestycja będą odczuwalne na terenie około 7,5 tys. ha. Zanieczyszczeniu ulegnie gleba, powietrze i wody gruntowe, drastycznie wzrośnie poziom natężenia hałasu i penetracja ludzka. Wyraźnie zwiększy się również śmiertelność zwierząt. Droga zagrozi nie tylko zwierzętom żyjącym w jej bezpośrednim sąsiedztwie. Pod znakiem zapytania stanie także przetrwanie populacji dużych ssaków w całym regionie, ponieważ trasa szybkiego ruchu przetnie naturalne szlaki ich wędrówek. W niebezpieczeństwie znajdą się podlaskie łosie, a także objęte ścisłą ochroną rysie i wilki. Zagrożone będą również liczne gatunki ptaków.
Łomżyński wariant korytarza Wariant pozwala na ominięcie wszystkich wymienionych w wariancie białostockim, obszarów cennych przyrodniczo oraz zachowanie ciągłości korytarzy migracyjnych dużych ssaków pomiędzy kompleksami leśnymi. Wariant ten jest krótszy o 30-40 km przez co jest tańszy w realizacji.